空氣熱交換器使用時間長了，因為結垢或一些雜質阻塞通道，會使換熱作用下降，進出口壓差加大，呈現這些現狀時，空氣熱交換器就要思考清潔了。空氣熱交換器的保護需要由專業的公司來進行，包含空氣熱交換器清潔、空氣熱交換器修理、空氣熱交換器板片創新、空氣熱交換器密封墊替換、空氣熱交換器擴容等。
       清潔方法有兩種，一種是循環清潔即是通過循環泵把清潔液（清潔液能加熱作用非常好）打進板換裏進行循環，這種方法對結垢後的清潔作用較好。若板換通道被雜質阻塞時就隻有拆開來清潔了，鬆螺母前先量好夾緊尺度並記載下來，然後對角鬆開螺母，把夾緊板向後推至後支持處板片就可以拿出來清潔了，清潔結束後從新安裝上去（若密封膠墊有損壞則需替換新的膠墊），對角夾緊到記載的尺度上即可。第一種清潔方法的優點是清潔對比方便，不足之處是清潔不行潔淨。第二種清潔方法的優點是可以把板片清潔的很潔淨，不足之處是拆裝對比費事，可能要替換密封膠墊。